thumb|left|Russisch-orthodoxe kerk van Alajõe Alajõe is een plaats in de Estlandse gemeente Alutaguse (Estisch: Alutaguse vald), provincie Ida-Virumaa. De plaats telt 155 inwoners (2021), Estisch bureau voor de statistiek, interactieve kaart. en heeft de status van dorp (Estisch: küla). De meerderheid van de inwoners is Russischtalig.
Alajõe was tot in 2017 de hoofdplaats van de gelijknamige gemeente.
Bij Alajõe mondt de rivier Alajõgi uit in het Peipusmeer.
Categorie:Plaats in Estland