Hieronder vindt u een lijst van zoogdieren in Afghanistan. In totaal zijn er 140 zoogdiersoorten opgenomen in deze lijst. Alle gegevens zijn afkomstig van de IUCN rode lijst.
orde Eulipotyphla (Insecteneters)
familie Erinaceidae (Egels) Langooregel (Hemiechinus auritus)
Egel van Brandt (Paraechinus hypomelas)
familie Soricidae (Spitsmuizen) Tuinspitsmuis (Crocidura suaveolens)
Wimperspitsmuis (Suncus etruscus)
Muskusspitsmuis (Suncus murinus)
Crocidura zarudnyi
Crocidura gmelini
Orde Chiroptera (vleermuizen)
familie Rhinopomatidae (Klapneusvleermuizen) Kleine klapneusvleermuis (Rhinopoma hardwickii)
Rhinopoma muscatellum
familie Megadermatidae (Reuzenoorvleermuizen) Lierneusvleermuis (Lyroderma Lyra)
familie Rhinolopidae (Hoefijzerneuzen) Kleine hoefijzerneus (Rhinolophus hipposideros)
Grote hoefijzerneus (Rhinolophus ferrumequinum)
Rhinolophus bocharicus
Rhinolophus lepidus
Blasius' hoefijzerneus (Rhinolophus blasii)
familie Hipposiderae (Bladneusvleermuizen van de Oude Wereld) Drietandbladneusvleermuis (Asellia tridens)
Hipposideros fulvus
familie Emballonuridae (Schedestaartvleermuizen) Kaalbuikgrafvleermuis (Taphozous nudiventris)
familie Molossidae (Bulvleermuizen) Europese bulvleermuis (Tadarida teniotis)
Tadarida aegyptiaca
familie Miniopteridae Miniopterus pallidus
familie Vespertilionidae (Gladneuzen) Bosvleermuis (Nyctalus leisleri)
Tweekleurige vleermuis (Vespertilio murinus)
Savi's dwergvleermuis (Hypsugo savii)
Rosse vleermuis (Nyctalus noctula)
Kleine vale vleermuis (Myotis blythii)
Ingekorven vleermuis (Myotis emarginatus)
Bechsteins vleermuis (Myotis bechsteinii)
Scotophilus heathii
Otonycteris leucophaea
Barbastella darjelingensis
Myotis bucharensis
Pipistrellus coromandra
Barbastella leucomelas
Myotis longipes
Rhyneptesicus nasutus
Hemprichs langoorvleermuis (Otonycteris hemprichii)
Plecotus wardi
Pipistrellus aladdin
Pipistrellus tenuis
Gewone dwergvleermuis (Pipistrellus pipistrellus)
Plecotus strelkovi
Nyctalus montanus
Kuhls dwergvleermuis (Pipistrellus kuhlii)
Eptesicus gobiensis
Eptesicus ognevi
Myotis nipalensis
Myotis formosus
Laatvlieger (Eptesicus serotinus)
orde Carnivora (roofdieren)
familie Felidae (Katachtigen) Caracal (Caracal caracal)
Tijger (Panthera tigris)
Vos (Vulpes vulpes)
Wilde kat (Felis silvestris)
Luipaard (Panthera pardus)
Euraziatische lynx (Lynx lynx)
Sneeuwpanter (Panthera uncia)
Leeuw (Panthera leo)
Bengaalse tijgerkat (Prionailurus bengalensis)
Manoel (Otocolobus manul)
Jachtluipaard (Acinonyx jubatus)
Moeraskat (Felis chaus)
familie Viverridae (Civetkatachtigen) Loewak (Paradoxurus hermaphroditus)
familie Herpestidae (Mangoesten) Herpestes auropunctatus
Indische ichneumon (Herpestes edwardsii)
familie Hyaenidae (Hyena's) Gestreepte hyena (Hyaena hyaena)
familie Canidae (Hondachtigen) goudjakhals (Canis aureus);
Wolf (Canis lupus)
Aziatische wilde hond (Cuon alpinus)
Steppevos (Vulpes corsac)
Afghaanse vos (Vulpes cana)
Zandvos (Vulpes rueppellii)
familie Ursidae (Beren) Bruine beer (Ursus arctos)
Aziatische zwarte beer (Ursus thibetanus)
familie Mustelidae (Marterachtigen) Das (Meles meles)
Otter (Lutra lutra)
Wezel (Mustela nivalis)
Gevlekte bunzing (Vormela peregusna)
Hermelijn (Mustela erminea)
Steenmarter (Martes foina)
Bergwezel (Mustela altaica)
Maleise bonte marter (Martes flavigula)
orde Onevenhoevigen (Perissodactyla)
familie Equidae (paardachtigen) Onager (Equus hemionus)
Orde Artiodactyla (evenhoevigen)
familie Suidae (Varkens) Wild zwijn (Sus scrofa)
familie Bovidae (Holhoornigen) Kropgazelle (Gazella subgutturosa)
Siberische steenbok (Capra sibirica)
Schroefhoorngeit (Capra falconeri)
Indische gazelle (Gazella bennettii)
Bezoargeit (Capra aegagrus)
Argali (Ovis ammon)
Oerial (Ovis vignei)
familie Moschidae (Muskusherten) Moschus cupreus
familie Cervidae (Hertachtigen) Cervus hanglu
orde Lagomorpha (Haasachtigen)
familie Ochotonidae (Fluithazen) Grootoorfluithaas (Ochotona macrotis)
Perzische fluithaas (Ochotona rufescens)
familie Leporidae (Hazen en konijnen) Lepus tibetanus
Tolaihaas (Lepus tolai)
orde Rodentia (Knaagdieren)
familie Hystricidae (Stekelvarkens van de Oude Wereld) Witstaartstekelvarken (Hystrix indica)
familie Sciuridae (Eekhoorns) Tagoean (Petaurista petaurista)
Gele grondeekhoorn (Spermophilus fulvus)
Eoglaucomys fimbriatus
Langstaartmarmot (Marmota caudata)
Afghaanse groneekhoorn (Spermophilopsis leptodactylus)
familie Gliridae (Slaapmuizen) Bosslaapmuis (Dryomys nitedula)
familie Dipodidae (Jerboa's) Hotsonpaardenspringmuis (Allactaga hotsoni)
Allactaga williamsi
Salpingotulus michaelis
Allactaga elater
familie Calomyscidae Calomyscus baluchi
Calomyscus mystax
Calomyscus elburzensis
familie Muridae Huismuis (Mus musculus)
Meriones zarudnyi
Gerbillus aquilus
Meriones hurrianae
Perzische bosmuis (Apodemus witherbyi)
Kleine bosmuis (Apodemus uralensis)
Aziatische zwarte rat (Rattus tanezumi)
Wards bosmuis (Apodemus pallipes)
Perzische woestijnmuis (Meriones persicus)
Meriones crassus
Indische naaktzoolrenmuis (Tatera indica)
Kortstaartmolrat (Nesokia indica)
Gerbillus nanus
Grote renmuis (Rhombomys opimus)
Meriones libycus
Rattus pyctoris
Chinese renmuis (Meriones meridianus)
Gerbillus campestris
familie Cricetidae Woelrat (Arvicola amphibius)
Blanfordimys bucharensis
Neodon juldaschi
Microtus transcaspicus
Trekhamster (Cricetulus migratorius)
Microtus ilaeus
Blanfordimys afghanus
Alticola argentatus
Zuidelijke aardlemming (Ellobius fuscocapillus)
orde Primates (primaten)
familie Cercopithecidae (Apen van de Oude Wereld) Resusaap (Macaca mulatta)
Berghoelman (Semnopithecus schistaceus)
Afghanistan