De wedstrijd voor mannen tijdens de Nederlandse kampioenschappen marathonschaatsen op kunstijs 1999 werd op 2 januari 1999 verreden op de De Scheg in Deventer, Overijssel. Ruud Borst werd kampioen. Het zilver werd gewonnen door Henk Angenent en het brons door Miel Rozendaal.
Verloop De wedstrijd ging over 150 ronden (60 kilometer) en werd afgelegd in een tijd van 1 uur, 30 minuten en 6 seconden.
Na veertig ronden ontstond een ontsnapping van Arnold Stam, Henri Ruitenberg, Henk van Benthem, Haico Bouma en Bram Sikma. Zij namen een ronde voorsprong op het peloton. Later volgden nog dertien rijders hun voorbeeld, waardoor een kopgroep van achttien rijders ontstond. Van de favorieten ontbraken alleen Peter de Vries en Henk Heideman in de kopgroep. De kopgroep dunde in het verdere verloop van de wedstrijd uit tot twaalf rijders.
Henk Angenent en Peter Baars probeerde uit de kopgroep te ontsnappen, dat niet lukte. Angenent deed later opnieuw een poging, maar bij snelheden van ongeveer 40 kilometer per uur op de ijsbaan was het moeilijk om alleen weg te komen.
Twee ronden voor het einde reden Ruud Borst en Angenent weg uit de kopgroep van twaalf rijders. Angenent deed het meeste kopwerk, terwijl Borst hem op korte afstand volgde. In de laatste meters verslapte Angenent en wist Borst een kleine voorsprong te nemen. Vier meter voor de finish balde Borst zijn vuisten en stelde hij de nationale titel veilig.
Voor Borst was het zijn eerste nationale titel op kunstijs. Hij beschouwde de overwinning als zijn mooiste zege op kunstijs. Zijn favoriete overwinningen op natuurijs waren de Oldambtrit van 1996 en een marathon op de Weissensee.
Arnold Stam werd uitgeroepen tot de meest strijdlustige rijder van de wedstrijd.
Uitslag PlaatsNaamRuud BorstHenk AngenentMiel Rozendaal4Rob van Meggelen5Hans Pieterse6Koen Lankhaar7Willem Poelstra8Yep Kramer9Haico Bouma10Yoeri Lissenberg11Rudi Groenendal12Arnold Stam13René Ruitenberg14Lammert Huitema15Peter Baars16Roelof Burghoorn17Henk van Benthem18Jan Maarten Heideman19Jan Eise Kromkamp20Bram Sikma21Frans de Ronde22Erik Hulzebosch23Bert Kaan24Arjan Schreuder25Patrick Schmitz26Eric-Jan Hagedoorn27Hans Schipper28Hans van de Wetering29Arjan Smit30Piet Kleine31Albert Slomp32André Klompmaker33Peter de Vries34Yoeri Takken35Eric Feenstra36Jeroen de Vries
Categorie:Nederlandse kampioenschappen marathonschaatsen op kunstijs 1999 1999