Het oeuvre van Carl Nielsen kan op drie manieren weergegeven worden: verdeeld naar genres; op volgorde van de Fog/Schousboe-catalogus (FS); op volgorde van opusnummer; CNW (Carl Nielsen Werklijst) uit 2015.

Naar genre Symfonieën Symfonie nr. 1 in g mineur. FS 16, Opus 7. (1892-94) Symfonie nr. 2 De fire Temperamenter, "De Vier Temperamenten". FS 29, Opus 16. (1901-02) Symfonie nr. 3, Sinfonia espansiva. FS 60, Opus 27. (1910-11) Symfonie nr. 4, Det Uudslukkelige, "Het Onuitroeibare". FS 76, Opus 29. (1914-16) Symfonie nr. 5. FS 97, Opus 50. (1921-22) Symfonie nr. 6 Sinfonia semplice, "Eenvoudige Symfonie". FS 116. (1924-25)

Soloconcerten Vioolconcert. FS 61, Opus 33. (1911) Fluitconcert. FS 119. (1926) Klarinetconcert. FS 129, Opus 57. (1928)

Orkestmuziek Andante tranquillo e Scherzo. Orkestratie van delen van FS 3(a-i, k-t, v). (1887) Kleine Suite voor Strijkers. FS 6. (1888) Symfonische rhapsodie in F. FS 7. (1888) Helios Ouverture. FS 32, Opus 17. (1903) A Gunnar’s Dream. Ouverture. FS 46, Opus 39. (1907-08) Marseillaise (Rouget de Lisle), orkestratie van FS 403 (1909) Ved en ung Kunstners Baare, At the Bier of a Young Artist". Arrangement voor strijkorkest, voor de begrafenis van de schilder Oluf Hartmann. FS 58. (1910) Nærmere Gud til dig, "Nearer my God to Thee". Parafrase voor blaasinstrumenten. FS 63. (1912) Pan en Syrinx. FS 87, Opus 49. (1918) Een denkbeeldige reis naar de Faeröer. Ouverture. FS 123. (1927) Bøhmisk-dansk Folketone, "Boheems-Deense volksmelodie". Parafrase voor strijkorkest. FS 130. (1928)

Harmonieorkest Paraphrase over "Nærmere Gud til dig" (1912) Nu lyser løv i lunde, mars

Kamermuziek Diverse blaastrio's en kwartetten. FS 3a. (1879-83). (verloren gegaan) Strijkkwartet in d mineur. FS 3d. (1882-83) Fantasie voor klarinet en piano. FS 3h; Pianotrio in G majeur. FS 3i. (1883) Diverse delen voor Strijkkwartet. FS 3c. (1883-87) Strijkkwartet in F majeur. FS 3k. (1887) Strijkkwartet nr. 1, in g mineur. FS 4, Opus 13. (1887-88, bewerkt 1900) Strijkkwintet in G majeur. FS 5. (1888) Twee fantasieën voor hobo en piano FS8, opus 2; Strijkkwartet nr. 2, in f mineur. FS 11, Opus 5. (1890) Strijkkwartet nr. 3, in Es majeur. FS 23, Opus 14. (1897-98) Strijkkwartet nr. 4, in F majeur (Piacevolezza). FS 36, Opus 44. (1906, bewerkt 1919). Ved en ung kunstners baare (Aan de baar van een jonge kunstenaar). Voor strijkkwintet, voor de begrafenis van Oluf Hartmann. FS 58. (1910) Canto Serioso FS132, voor hoorn en piano Serenata in Vano (Vergeefse serenade). Voor klarinet, fagot, hoorn, cello en contrabas. FS 68. (1914) Drie delen uit Moderen uit FS 94 Blaaskwintet, voor fluit, hobo (althobo), klarinet, hoorn en fagot. FS 100, Opus 43. (1922)

Pianowerken Skomagerens Brudevals, "Cobbler's Wedding Waltz". FS 2. (dubious, 1878) Caractærstykker, "Twee karakterwerken". FS 3f. (1882-83) Vijf Pianowerken, opus 3. FS 10. (1890) 1. Folketune 2. Humoreske 3. Arabeske 4. Mignon 5. Alfedans. Symfonische suite. FS 19, Opus 8. (1894) I. Intonation: Grave II. Quasi Allegretto III. Andante IV. Finale: Allegro Humoreske Bagateller. FS 22, Opus 11. (1894-97) 1. Goddag! Goddag! 2. Snurretoppen 3. En lille langsom Vals 4. Sprællemanden 5. Dukke-March 6. Spilleværket Festpræludium "Ved Århundredskiftet", Festival Prelude. FS 24. (1900) Drømmen om 'Glade Jul', "The Dream of 'Silent Night'". FS 334. (1905) Chaconne. FS 79, Opus 32. (1916) Thema met variaties. FS 81, Opus 40. (1917) Piano Suite [Den Luciferiske, "The Luciferan"]. FS 91, Opus 45. (1919-20) Tre Klaverstykker, Drie Werken. FS 131, Opus 59. (1928) Klavermusik for Smaa og Store, "Pianomuziek voor jong en oud". 2 delen. FS 148, Opus 53. (1930) Pianostuk in C. FS 159. (1931)

Orgelwerken 29 smaa Præludier, "29 kleine preludes". FS 136, Opus 51. (1929) 2 efterladte Præludier, "2 nagelaten preludes". FS 137. (1930) Commotio. FS 155, Opus 58. (1931)

Vioolwerken Polka in A Majeur. FS 1. (1874) Prelude, thema en variaties FS 104, Opus 48. (1923) Prelude en presto. FS 128, Opus 52. (1927-28)

Opera's Voltooid in titel aktes première libretto 1898-1901 Saul og David, (Saul en David) 4 bedrijven 28 november 1902, Kopenhagen, Det Kongelige Teater Einar Christiansen naar het 1e boek Samuel uit het Oude Testament 1904-1906 Maskarade (Maskerade) 3 bedrijven 11 november 1906, Kopenhagen, Det Kongelige Teater Vilhelm Rasmus Andersen, naar het toneelstuk van Ludvig Baron von Holberg

Toneelmuziek En Aften paa Giske, "Een avond op Giske". Tekst door A. Munch. Ouverture naar het toneelstuk. FS 9. (1889) Snefrid. Tekst door H. Drachmann. FS 17. (1893, bewerkt in 1899) Atalanta. Tekst door G. Wied & J. Petersen. FS 30. (1901) (slechts een lied, tekst door J. Petersen) Hr. Oluf han rider, "Heer Oluf rijdt". Tekst door H. Drachmann. FS 37. (1906) Tove. Tekst door L. Holstein. FS 43. (1906-08) Willemoes. Tekst door L.C. Nielsen. FS 44. (1907-08) Forældre, "De ouders". Tekst door O. Bentzon. FS 45. (1908) (slechts één stuk voor piano) Ulvens Søn, "Het wolvenjong". Tekst door A. Aakjær. FS 50. (1909) (slechts twee liederen) Hagbarth og Signe, "Hagbarth en Signe". Tekst door A. Oehlenschlæger. FS 57. (1910) Sankt Hansaftenspil, "Een zomeravondspel". Tekst door A. Oehlenschlæger. FS 65. (1913) Fædreland, "Het vaderland". Tekst door E. Christiansen. FS 71. (1915) (slechts een lied en een stuk voor koor) Voorspel voor de Shakespeareviering. Tekst door H. Rode. FS 80. (1916) Løgneren, "De leugenaar". Tekst door J. Sigurjonsson. FS 88. (1918) (slechts een lied) Aladdin. Tekst door A. Oehlenschlæger. FS 89 (1918-19) Moderen, "De Moeder". Tekst door H. Rode. FS 94, Opus 41 (1920) Cosmus. Tekst door E. Christiansen. FS 98. (1921-22) (slechts twee liederen) Ebbe Skammelsen. Tekst door H. Bergstedt. FS 117. (1925) Amor og Digteren, "Amor en de dichter". Tekst door S. Michaelis. FS 150. (1930) Paaskeaftensspil, "Paasavondspel". Tekst door N.F.S. Grundtvig. FS 156. (1931)

Cantates Cantate voor het Lorens Frølich Festival. Tekst door A. Olrik. FS 26. (1900) Cantate voor de Studentenvereniging. Tekst door H. Drachmann. FS 31. (1901) Cantate for the Anniversary of Copenhagen University. Tekst door N. Møller. FS 47, Opus 24. (1908) Cantate for the Commemoration of 11 February 1659, for the 250th anniversary of the storming of Copenhagen. Tekst door L.C. Nielsen. FS 49. (1909) Cantate voor de openingsceremonie van de Nationale tentoonstelling Aarhus 1909. Tekst door L.C. Nielsen; in samenwerking met E. Bangert. FS 54. (1909) Cantate ter nagedachtenis aan P.S. Krøyer. Tekst door L.C. Nielsen. FS 56. (1909) Cantate voor het eeuwfeest van de Kamer van Koophandel. Tekst door V. Rørdam. FS 86. (1917) Cantate voor het eeuwfeest van de Polytechnic High School. Tekst door H.H. Seedorff Pedersen. FS 140. (1929) Cantate for the 50th Anniversary of the Young Merchants' Education Association. Tekst door H.H. Seedorff Pedersen. FS 153. (1930) Cantate for the opening of the Swimming Baths. Tekst door H.H. Seedorff Pedersen. FS 302. (1930) Cantate voor de opening van het Radium Station. Tekst door V. Rørdam. FS 303. (1931) Chorus for the 50th Anniversary of the Danish Cremation Union. Tekst door S. Michaelis. (1931)

Fog/Schousboe-catalogus Sinds 1965 is het gezamenlijk werk van Nielsen gecatalogiseerd door Dan Fog en Torben Schousboe. Deze catalogus is tot het nummer FS161 bijna geheel chronologisch op rij gezet (qua publicatie) op een enkele uitzondering na, FS132 en FS161. De nummers hoger dan FS161 zijn later teruggevonden.

FS 1. Polka in A gr.t. Voor viool. (1874) FS 2. Skomagerens Brudevals, "Cobbler's Wedding Waltz". Voor piano (1878?) FS 3. Diverse niet gepubliceerde werken, aanwezig in de Koninklijke Deense Bibliotheek. FS 3a. Diverse blaastrio's en kwartetten (1879-83, verloren gegaan) FS 3b. Sonate nr. 1 voor viool en piano in G gr.t. (1881-82) FS 3c. Diverse stukken voor Strijkkwartet (1883-87) FS 3d. Strijkkwartet in d kl.t. (1882-83). FS 3e. Duo (in drie delen) in A gr.t. voor twee violen (1882-83). FS 3f. Caractærstykker, "Twee Karakterstukken". Voor piano (1882-83) FS 3g. Vuggevise, "Lullaby" (1883) FS 3h: Fantasie voor klarinet en piano, g kl.t. (1881 of 1883-85) FS 3i: Pianotrio in G gr.t. (1883) FS 3k. Strijkkwartet in F gr.t. (1887) (verloren) FS 3l. Det bødes der for i lange Aar, "A moment of pleasure, An age of pain". Lied voor mannenkoor, tekst door J.P. Jacobsen. (1887) FS 3m. Længsel (I hvor jeg end slaaer Øjet hen), "Jean (Of a' the airts the wind can blaw)". Lied voor mannenkoor, tekst door Robert Burns; vertaald door Caralis (1887) FS 3n-s. Diverse liederen. Tekst door E. Aarestrup, J.S. Welhaven, G.B. Byron, P.B. Shelley, J.J. Callanan, R. Burns; vertaald door Caralis, pseudoniem van C. Preetzman (1887) FS 3t. Byd mig at leve, "To Athenea, who may commen him Anything". Lied voor mannenkoor, tekst door Robert Herrick; vertaald door Caralis (1887) FS 3u. Før drømte jeg fast hver eneste Nat, "Earlier I dreamt every single night". Lied voor mannenkoor, tekst door J.P. Jacobsen. (1887) FS 4. Strijkkwartet nr. 1, in g kl.t. (1887-88, bewerkt 1900) FS 5. Strijkkwintet in G gr.t. (1888) FS 6. Kleine Suite voor Strijkers (1887-8) FS 7. Symfonische rhapsodie in F (1888). Het eerste deel van een geplande symfonie FS 8: Twee fantasieën voor hobo en piano, opus 2 (1889) FS 9. En Aften paa Giske, "An Evening at Giske". Ouverture en koor voor het toneelstuk door A. Munch. (1889) FS 10. Vijf Pianowerken (1890) 1. Folk Tune 2. Humoresque 3. Arabesque 4. Mignon 5. Elf-Dance FS 11. Strijkkwartet nr. 2 in f kl.t. (1890) FS 12. Musik til fem Digte af J.P. Jacobsen, "Muziek bij vijf gedichten door J.P. Jacobsen" (1891) 1. Solnedgang, "Sunset" 2. I Seraillets Have, "In the Harem Garden" 3. Til Asali, "To Asali" 4. Irmelin Rose 5. Har dagen sanket al sin Sorg, "Has the Day Gathered All its Sorrow" FS 13. Ongepubliceerde liederen (1891) 1. Aldrig hans Ord kan jeg glemme (Paludan-Müller) 2. I Drømmenes Land (Jacobsen) 3. Solnedgang (Jacobsen) FS 14. Viser og Vers, "Liederen en verzen". Tekst door J.P. Jacobsen. (1891) 1. Genrebillede, "Genre Piece" 2. Seraferne, "The Seraphs" 3. Silkesko over gylden Læst, "Silken Shoes on a Golden Last" 4. Det bødes der for i lange Aar, "A Moment of Pleasure, an Age of Pain" 5. Vise af 'Mogens', "Lied from [the short story] 'Mogens'" FS 15. Duitse versie van geselecteerde liederen uit FS 12 & 14 (1891) FS 16. Symfonie Nr. 1 in g kl.t. (1890-92) FS 17. Snefrid. Theatermuziek, tekst door H. Drachmann. (1893, bewerkt in 1899) FS 18. Zes Liederen. Tekst door Ludvig Holstein (1895-6) 1. Du fine, hvide Æbleblomst, "You fine white apple blossom" 2. Erindringens Sø, "The Lake of Memories" 3. Sommersang, "Summer Lied" 4. Sang bag Ploven, "Lied Behind the Plow" 5. I Aften, "This Evening" 6. Hilsen, "Greetings" FS 19. Symfonische suite. Voor piano. (1894) FS 20. Vioolsonate nr. 1 in A gr.t. voor viool en piano (1895) FS 21. Hymnus amoris. Koor, Deense tekst door A. Olrik; Latijnse vertaling door Johan Ludvig Heiberg. (1896-97) FS 22. Humoreske Bagateller. Voor piano.(1894-97) 1. Goddag, Goddag, "How do you do? " 2. Sprællemanden, "The Jumping Jack" 3. Snurretoppen, "The Spinning-top" 4. En lille langsom Vals, "Een kleine langzame wals" 5. Dukkemarche, "Doll's march" 6. Spilleværket, "The Musical Box" FS 23. Strijkkwartet nr. 3, in Es gr.t. (1897-98) FS 24. Festpræludium, Festival Prelude. Voor piano (1899) FS 25. Saul en David. Opera in vier akten. Libretto door E. Christiansen naar Samuel I en II. (1898-1901) FS 26. Cantata for the Lorens Frølich Festival. Koor, tekst door A. Olrik. (1900) FS 27. Edderkoppens Sang, "The Spider's Lied". Koor, tekst door A. Oehlenschlæger. (1899). FS 28. Kom Blankeste Sol, "Come, bright sun". Koor, tekst door A. Thura. (1901) FS 29. Symfonie Nr. 2 (1901-02) FS 30. Atalanta. Een lied voor het toneelstuk door Jens Petersen & Gustav Wied. (1901).