Het 55e seizoen van de UEFA Cup (2005/06) begon voor de meeste clubs in de voorrondes. Maar het echte toernooi begon pas op 15 september. Twee clubs traden op 10 mei 2006 in de finale aan. Deze finale werd in het Philips Stadion in het Nederlandse Eindhoven gehouden. De Spaanse club Sevilla FC won in de finale met 0-4 tegen het Engelse Middlesbrough FC.

In de eerste wedstrijd speelt Team #1 thuis, in de tweede wedstrijd speelt Team #2 thuis. Vetgedrukte clubs gaan door.

Voorrondes 87 clubs begonnen dit seizoen in eerste of tweede voorronde. Van deze 87 clubs konden slechts 31 zich voor de eindronde plaatsen.

Eerste voorronde Dit waren de uitslagen van de eerste ronde van de UEFA Cup 2005-2006:

Team #1 Tot. Team #2 1ste wed 2de wedBaškimi Kumanovo 4 - 1 Žepče Limorad 3 - 0 1 - 1Birkirkara 0 - 6 Apoel Nicosia 0 - 2 0 - 4UE Sant Julià 0 - 10 Rapid Boekarest 0 - 5 0 - 5KS Teuta 3 - 4 NK Široki Brijeg 3 - 1 0 - 3KS Elbasani 1 - 1 (u) Vardar Skopje 1 - 1 0 - 0Omonia Nicosia 6 - 0 Hibernians FC 3 - 0 3 - 0FC Domagnano 0 - 8 NK Domzale 0 - 5 0 - 3Ferencváros 2 - 3 MTZ-RIPO Minsk 0 - 2 2 - 1Banants Jerevan 4 - 3 Lokomotivi Tbilisi 2 - 3 2 - 0Torpedo Koetaisi 0 - 6 FC BATE Barisaw 0 - 1 0 - 5FC Vaduz 2 - 1 Dacia Chisinau 2 - 0 0 - 1FK Bakoe 2 - 3 MŠK Žilina 1 - 0 1 - 31. FSV Mainz 05 4 - 0 MIKA Asjtarak 4 - 0 0 - 0Nistru Otaci 5 - 2 Khazar Lenkoran 3 - 1 2 - 1Longford Town 3 - 5 Carmarthen Town 2 - 0 1 - 5FK Ekranas 1 - 2 Cork City 0 - 2 1 - 0ÍBV Vestmannaeyjar 2 - 3 B36 Tórshavn 1 - 1 1 - 2AC Allianssi 4 - 1 CS Pétange 3 - 0 1 - 1Linfield FC 2 (u) - 2 FK Ventspils 1 - 0 1 - 2NSÍ Runavik 0 - 6 Liepajas Metalurgs 0 - 3 0 - 3Etzella Ettelbruck 0 - 6 ÍB Keflavik 0 - 4 0 - 2Portadown FC 1 - 3 Viking FK 1 - 2 0 - 1TVMK Tallinn 1 - 2 Myllykosken Pallo-47 1 - 1 0 - 1Rhyl FC 4(u) - 4 FK Atlantas 2 - 1 2 - 3Esbjerg fB 7 - 2 Flora Tallinn 1 - 2 6 - 0

Tweede voorronde In de tweede voorronde spelen de 25 winnaars van de eerste voorronde en 37 andere clubs. Een van deze 37 is het Belgische KRC Genk zij speelden tegen het Letse Liepajas Metalurgs.

KRC GenkOp 11 augustus speelden Metalurg en Genk voor het eerst tegen elkaar in Liepaja. Al in de 16e minuut opende de Let Mindaugas Kalonas de score van zijn ploeg; 1-0. Na rust maakte Kevin Vandenbergh voor Genk gelijk. In de 59e minuut kwam Genk op voorsprong door een doelpunt van Koen Daerden. De 1-3 voor Genk werd in de 81e minuut gemaakt door Nenad Stojanović en de eindstand werd nog geen twee minuten later verzegeld door een strafschop van Viktors Dobrecovs.Op 25 augustus werd het tweede duel gespeeld in Genk. De eindstand van de wedstrijd werd binnen een half uur bepaald: in de 8e minuut scoorde Kevin Vandenbergh de 1-0, tien minuten later was het Koen Daerden die de 2-0 aantekende en de 3-0 weer tien minuten later werd gemaakt door Nenad Stojanović. De 3-0 zorgde voor een 6-2-overwinning voor Genk over twee duels waarmee het zich plaatste voor de UEFA Cup.

UitslagenDit waren de uitslagen van de tweede ronde van de UEFA Cup 2005-2006: Team #1 Tot. Team #2 1ste wed 2de wedZeta Golubovci 2 - 5 NK Široki Brijeg 0 - 1 2 - 4FSV Mainz 05 4 - 0 ÍB Keflavik 2 - 0 2 - 0Halmstads BK 5 - 3 Linfield FC 1 - 1 4 - 2Liepajas Metalurgs 2 - 6 Racing Genk 2 - 3 0 - 3Myllykosken Pallo-47 2 - 2 Dundee United 0 - 0 2 - 2FC Kopenhagen 4 - 0 Carmarthen Town 2 - 0 2 - 0Djurgårdens IF 1 - 1 Cork City 1 - 1 0 - 0MŠK Žilina 3 - 4 Austria Wien 1 - 2 2 - 2NK Inter Zaprešić 1 - 7 Rode Ster Belgrado 1 - 3 0 - 4Nistru Otaci 0 - 3 Grazer AK 0 - 2 0 - 1OFK Beograd 2 - 2 Lokomotiv Plovdiv 2 - 1 0 - 1Rapid Boekarest 4 - 1 Vardar Skopje 3 - 0 1 - 1Litex Lovetsj 2 - 2 NK Rijeka 1 - 0 1 - 2FC Vaduz 1 - 6 Beşiktaş JK 0 - 1 1 - 5Krylia Sovetov Samara 4 - 0 BATE Borisov 2 - 0 2 - 0Legia Warschau 1 - 5 FC Zürich 0 - 1 1 - 4SK Brann 2 - 0 AC Allianssi 0 - 0 2 - 0Dinamo Boekarest 4 - 3 Omonia Nicosia 3 - 1 1 - 2Publikum Celje 1 - 3 Levski Sofia 1 - 0 0 - 3Rhyl FC 0 - 3 Viking FK 0 - 1 1 - 2Apoel Nicosia 3 - 2 Maccabi Tel Aviv 1 - 0 2 - 2 (n.v.)FC Midtjylland 3 - 2 B36 Tórshavn 2 - 1 2 - 2Esbjerg fB 1 - 1 (2-3 n.p.) Tromsø IL 0 - 1 1 - 0Grasshopper-Club Zürich 3 - 3 Wisła Płock 1 - 0 2 - 3MFC Sopron 1 - 5 Metalloerg Donetsk 0 - 3 1 - 2SV Pasching 3 - 3 Zenit Sint-Petersburg 2 - 2 1 - 1Dyskobolia Grodzisk Wielkopolski 4 - 1 Dukla Banská Bystrica 4 - 1 0 - 0FC Banants 2 - 8 Dnipro Dnipropetrovsk 2 - 4 0 - 4Ashdod SC 3 - 3 NK Domžale 2 - 2 1 - 1Baškimi Kumanovo 0 - 11 Maccabi Petach-Tikwa 0 - 5 0 - 6MTZ-RIPO Minsk 2 - 3 FK Teplice 1 - 1 1 - 2 n.v. = na verlenging n.p. = na penalty's

Eerste ronde Aan de eerste ronde doen naast de 31 clubs uit de voorronde, ook de 16 verliezende clubs uit de derde Champions League voorronde mee en de winnaars van de UEFA Intertoto Cup. De 30 overige clubs waren al geplaatst vanwege de UEFA-coëfficiënten van hun land of, in het geval van CSKA Moskou, de UEFA Cup van 2005 te winnen. Namens België doet naast KRC Genk ook GBA mee. Nederland wordt vertegenwoordigd door AZ, Feyenoord, SC Heerenveen en Willem II.

Germinal Beerschot In Antwerpen vond op 15 september de wedstrijd tussen GBA en het Franse Olympique Marseille plaats. In deze wedstrijd vielen echter geen doelpunten.In de terugwedstrijd op 29 september bleef het ook 0-0, hetzelfde geldt voor de verlenging. Dat betekende dat een strafschoppenserie de ploeg moest aangeven die doorging. In de strafschoppenserie misten Dickson Agyeman en Sezer Öztürk namens GBA terwijl alle spelers van Olympique wel scoorde, dit betekende de uitschakeling van Germinal Beerschot.

Feyenoord Op 15 september was de Rotterdamse Kuip leeg toen Feyenoord daar speelt tegen Rapid Boekarest. Dit vanwege de rellen tijdens Feyenoord - Sporting Lissabon op 24 februari 2005. Vlak voor rust zette Dirk Kuijt Feyenoord op voorsprong. In de tweede helft kreeg Rapid een strafschop na een handsbal van Serginho Greene. Ciprian Vasilache benutte deze strafschop waardoor de uitslag op 1-1 werd bepaald.De return in Boekarest leverde na een klein half uur spelen een doelpunt op voor Rapid dankzij Mugurel Buga. Na negentig minuten stond nog steeds de 1-0 op het bord wat betekende dat Feyenoord de onderlinge ontmoeting met 2-1 had verloren en uitgeschakeld was.

AZ In het Russisch Samara vond op 15 september het eerste duel plaats tussen Kryl'ja Sovetov en AZ. Het zou een doelpuntrijke wedstrijd worden. Al in de 12e minuut scoorde Leiton de 1-0. Maar in de 18e minuut scoorde Ron Vlaar de gelijkmaker. Vlak voor rust bepaalde Baba Adamu de ruststand op 2-1. Vlak na rust was het al 3-1 door Denis Kovba. De 3-2 kwam op naam van Kenneth Pérez, maar binnen tien minuten was het verschil alweer twee in het voordeel van de Russische club: Andrij Hoesin scoorde de 4-2. Toen Barry van Galen de 4-3 scoorde in de 85e minuut leek het daarbij te blijven maar ver in de blessuretijd scoorde Anton Bober de 5-3.In de Alkmaarderhout probeerde AZ de 5-3-achterstand van de heenwedstrijd weg te werken. Na 15 minuten zag het ernaar uit dat dit niet zou lukken want Adanu had toen al de 0-1 gecoord. Vlak voor rust kwam AZ terug in de wedstrijd door de gelijkmaker van Barry van Galen. Met nog twintig minuten te spelen kreeg Adumu een rode kaart voor natrappen. Een kleine tien minuten later bracht invaller Danny Koevermans de stand op 2-1. Ruim vijf minuten later kreeg AZ een strafschop doordat Pérez in de rug werd gelopen. Denny Landzaat benutte deze strafschop waardoor hij de eindstand vast legde. Door de 3-1-overwinning plaats AZ zich door een reglementaire (uitdoelpunt-regel) 6-6 overwinning.

KRC Genk In het Bulgaarse Lovetsj werd op 15 september de wedstrijd Litex Lovetsj - KRC Genk gespeeld. In de eerste helft bleef het 0-0. Maar in de 53e scoorde Koen Daerden de 0-1 voor Genk. Maar in de 65e stond het alweer 1-1 door Michail Venkov. Lang leek het 1-1 te blijven te dat Nenad Stojanović de 1-2 scoorde in de 85e minuut. Milivoje Novakovič besliste het duel in een 2-2 gelijkspel.In de return werd in de tweede helft het enige doelpunt van de wedstrijd gescoord doelpuntenmaker was een speler met de bijnaam Sandrinho (Sandertje) namens Litex. Dit betekende dat Genk door een 2-1 nederlaag in deze onderlinge ontmoeting uitgeschakeld was.

SC Heerenveen Ostrava was 15 september het strijdpodium voor FC Baník Ostrava en SC Heerenveen. In de 28e minuut bracht Maros Klimpl Baník via een lage kopbal op voorsprong. Ruim een kwartier later kwam de eindstand al op het bord na een wilde ingreep van Boy Waterman kreeg Baník een strafschop die door Lukas Magera werd benut, 2-0. In de tweede helft leek Klaas-Jan Huntelaar nog te scoren maar deze werd wegens buitenspel afgekeurd.In het Abe Lenstra Stadion moest SC Heerenveen proberen de 2-0-achterstand zien goed te maken. Aan deze taak was na de eerste helft al voldaan toen Georgios Samaras en Lasse Nilsson vroeg resp. laat in de eerste helft scoorden. De doelpunten die in de tweede helft vielen, vielen binnen een tijdbestek van nog geen 10 minuut, Klaas Jan Huntelaar, Uğur Yıldırım en weer Huntelaar scoorden en brachten de eindstand op 5-0 en over twee wedstrijden op 5-2 wat betekende dat Heerenveen zich voor de tweede ronde had geplaatst.

Willem II In het Stade Louis II te Monaco moet Willem II het 15 september opnemen tegen AS Monaco. Olivier Kapo zette de Monagasken in de eerste helft op 1-0 en Emmanuel Adebayor zette vlak na de rust de 2-0-eindstand op het bord.Op 29 speelde de clubs weer tegen elkaar maar nu in Tilburg pas in de tweede helft werd er gescoord: Maicon opende de score en later maakte Adebayor de 2-0. Tegen het einde van de wedstrijd deed Willem II nog wat terug via Anouar Hadouir maar vlak voor tijd maakte Javier Chevantón de 1-3 waardoor Willem II over twee wedstrijd met 5-1 werd uitgeschakeld.

Wedstrijden Team #1 Tot. Team #2 1ste wed 2de wedMiddlesbrough FC 2 - 0 Skoda Xanthi 2 - 0 0 - 0PAOK Saloniki 3 - 3 Metalloerh Donetsk 1 - 1 2 - 2Litex Lovetsj 3 - 2 Racing Genk 2 - 2 1 - 0Sevilla FC 2 - 0 FSV Mainz 05 0 - 0 2 - 0Germinal Beerschot 0 - 0 (1-4 n.p.) Olympique Marseille 0 - 0 0 - 0Viking FK 2 - 2 Austria Wien 1 - 0 1 - 2Vitória Guimarães 4 - 0 Wisła Kraków 3 - 0 1 - 0FC Basel 6 - 0 NK Široki Brijeg 5 - 0 1 - 0Bolton Wanderers 4 - 2 Lokomotiv Plovdiv 2 - 1 2 - 1Grazer AK 0 - 7 RC Strasbourg 0 - 2 0 - 5Maccabi Petah-Tikva 5 - 4 Partizan Belgrado 0 - 2 5 - 2SK Brann 3 - 5 Lokomotiv Moskou 1 - 2 2 - 3Dinamo Boekarest 5 - 2 Everton FC 5 - 1 0 - 1FC Baník Ostrava 2 - 5 SC Heerenveen 2 - 0 0 - 5Bayer Leverkusen 0 - 2 CSKA Sofia 0 - 1 0 - 1Brøndby IF 3 - 2 FC Zürich 2 - 0 1 - 2Apoel Nicosia 1 - 4 Hertha BSC Berlin 0 - 1 1 - 3Feyenoord 1 - 2 Rapid Boekarest 1 - 1 0 - 1AJ Auxerre 2 - 2 Levski Sofia 2 - 1 0 - 1Sjachtar Donetsk 6 - 1 Debreceni VSC 4 - 1 2 - 0Krylia Sovetov Samara 6 - 6 AZ Alkmaar 5 - 3 1 - 3Grasshoppers 4 - 1 Myllykosken Pallo-47 1 - 1 3 - 0Palermo 6 - 1 Anorthosis Famagusta 2 - 1 4 - 0AS Roma 5 - 1 Aris Saloniki 5 - 1 0 - 0CSKA Moskou 6 - 2 FC Midtjylland 3 - 1 3 - 1Hibernian FC 1 - 5 Dnipro Dnipropetrovsk 0 - 0 1 - 5FK Teplice 1 - 3 RCD Espanyol 1 - 1 0 - 2Hamburger SV 2 - 1 FC Kopenhagen 1 - 1 1 - 0Zenit 1 - 0 AEK Athene 0 - 0 1 - 0RC Lens 5 - 3 Dyskobolia Grodzisk Wielkopolski 1 - 1 4 - 2VfB Stuttgart 2 - 1 NK Domžale 2 - 0 0 - 1Halmstads BK 4 - 4 Sporting Lissabon 1 - 2 3 - 2 (dts)Rode Ster Belgrado 1 - 1 SC Braga 0 - 0 1 - 1Vitória Setúbal 1 - 2 Sampdoria 1 - 1 0 - 1Beşiktaş JK 4 - 2 Malmö FF 0 - 1 4 - 1Stade Rennais 3 - 1 Osasuna 3 - 1 0 - 0AS Monaco 5 - 1 Willem II 2 - 0 3 - 1Vålerenga IF 1 - 6 Steaua Boekarest 0 - 3 1 - 3Slavia Praag 4 - 1 Cork City 2 - 0 2 - 1Tromsø IL 2 - 1 Galatasaray 1 - 0 1 - 1

Tweede ronde Net als het voorgaande seizoen zal ook in dit seizoen de tweede ronde een groepsfase zijn. De veertig overgebleven clubs worden in acht groepen van vijf geloot. De clubs zijn hiervoor in 5 potten gestopt waarbij de sterkst clubs in pot 1 zitten en de zwakste clubs volgens de UEFA-coëfficiënt in pot 5.

Groep A