Merklinghausen ist der Name folgender Orte:

Merklinghausen (Attendorn), Stadtteil von Attendorn Merklinghausen (Bödefeld), Wüstung bei Bödefeld Merklinghausen (Hallenberg), Wüstung im südöstlichen Sauerland, jetzt zu Hallenberg Merklinghausen-Wiggeringhausen, Ortsteil von Erwitte