Een Nederlandse plaats: Bovenkerk (Amstelveen), dorp in Noord-Holland. Bovenkerk (Diemen), voormalige buurtschap in Noord-Holland. Bovenkerk (Zuid-Holland), buurtschap in de gemeente Krimpenerwaard.
Overige betekenissen: Een kerkgebouw, waarvan de diensten op de bovenverdieping plaatsvinden. Bovenkerk (Kampen), een kerkgebouw in Kampen. Frank Bovenkerk, een Nederlands cultureel antropoloog en criminoloog.