De individuele tijdrit voor mannen elite op de wereldkampioenschappen wielrennen 2006 werd gehouden op 21 september. De 52 deelnemers moesten een parcours van 50,83 kilometer in en rond de Oostenrijkse stad Salzburg afleggen. De Zwitser Fabian Cancellara won, voor de Amerikaan David Zabriskie en de Kazach Aleksandr Vinokoerov. Cancellara behaalde daarmee zijn eerste wereldtitel in deze discipline.
De Pool Peter Mazur ging als enige niet van start.
Uitslag Plaats Naam Land Tijd 20px Fabian Cancellara 1u00'11,75" David Zabriskie + 1'29,97" Aleksandr Vinokoerov + 1'49,72" 4 Brian Vandborg + 1'53,10" 5 Sebastian Lang + 2'08,85" 6 Vasil Kiryjenka + 2'13,65" 7 Leif Hoste + 2'31,28" 8 Michael Rogers + 2'31,86" 9 Andrij Hryvko + 2'45,03" 10 Vladimir Goesev + 2'53,71" 11 Andrej Kasjetsjkin + 2'54,05" 12 Raivis Belohvoščiks + 2'57,36" 13 Stijn Devolder + 2'57,87" 14 José Iván Gutiérrez + 3'07,46" 15 David Millar + 3'21,99" 16 Vincenzo Nibali + 3'27,01" 17 David George + 3'34,13" 18 Robert Hunter + 3'39,83" 19 László Bodrogi + 3'51,02" 20 Marco Pinotti + 3'52,81" 21 Ben Day + 3'53,42" 22 Ryder Hesjedal + 4'12,29" 23 Peter Luttenberger + 4'12,82" 24 Stef Clement + 4'16,13" 25 Gustav Larsson + 4'23,46" 26 Chris Baldwin + 4'41,82" 27 Andreas Klöden + 4'42,21" 28 Svein Tuft + 4'45,57" 29 Thomas Lövkvist + 4'59,26" 30 David O'Loughlin + 5'02,61" 31 Aleksandr Bespalov + 5'05,62" 32 Ondřej Sosenka + 5'15,38" 33 Joerij Kryvtsov + 5'16,21" 34 Marlon Pérez + 5'27,37" 35 Ruslan Ivanov + 5'30,08" 36 Adrián Bonilla + 5'32,69" 37 Denis Sjkarpeta + 5'45,81" 38 Matti Helminen + 5'55,23" 39 David McCann + 6'01,39" 40 František Raboň + 6'17,06" 41 Christophe Kern + 6'25,95" 42 Joost Posthuma + 6'37,14" 43 Knut Anders Fostervold + 6'40,17" 44 Benoît Vaugrenard + 6'42,55" 45 Michael Schär + 6'44,76" 46 Gregor Gazvoda + 7'00,93" 47 Thomas Rohregger + 7'34,86" 48 Pedro Nicácio + 8'38,05" 49 Erik Hoffmann + 8'42,32" 50 Zoltán Remák + 9'05,05" 51 Csaba Szekeres + 9'05,90" 52 Vitālijs Korņilovs + 12'13,37"
Individuele tijdrit mannen elite